Команда вчених-ніндзя Гатчамен II

Світ було відновлено Землі... але ненадовго. Через два короткі роки Сосай Ікс оголошує про своє повернення, врізавшись у круїзний лайнер Куін Маргарет і потопивши його; викрадає одну з тих, що вижили - чотирирічну дівчинку на ім'я Семмі Доктор Пандора і насильно перетворює її на Джельсадору, наступного генерала Галлактора. Синдикат відновлює свої сили і починає захоплювати військових та наукових експертів, не залишаючи ІСО іншого виходу, крім відродити свою власну першу лінію оборони: Кагаку Ніндзятай. Але тепер, коли Кондор Дзе зник безвісти і вважається загиблим, все не зовсім так, як раніше, і навіть із новою зброєю та транспортними засобами команда розгублена. Доктор Кодзабуро Намбу посилює проблему, залучаючи нового G-2, Гетца Яструб.